司婧娜

[发布日期:2012-06-29 点击数: ]
 
司婧娜,博士,讲师。
E-mail:sijingna@gmail.com
电话:
 
 
 
  研究方向  
 

1、组学数据整合和信息挖掘

2、蛋白质生物信息学

 
  学习、工作经历  
 

2002年9月-2006年6月,山东农业大学,生命科学学院生物技术专业,获学士学位

2006年9月-2011年6月,中国农业大学,生物学院生物信息学专业,获博士学位

2011年7月至今,北京林业大学,生物科学与技术学院计算生物学与生物信息学学科,讲师

 
  承担项目  
 

1、胡杨应答盐胁迫转录组测序分析及基因表达调控网络的构建 国家自然科学基金青年项目 主持

2、毛白杨基因表达与生长动态的表型可塑性模型 高等学校博士学科点专项科研基金 主持

3、胡杨天然群体的遗传结构分析 北京林业大学科研启动基金 主持

4、整合基因网络的高效林木育种技术研究与示范 林业公益性行业科研专项重大项目 参与

5、森林植物发育生物学研究团队 北京林业大学科技创新计划项目 参与

 
  发表文章情况  
 

1、Jingna Si, Xiyang Zhao, Xinyin Zhao, Rongling Wu, Systematic functional genomics resource and annotation for Poplar, IET Systems Biology. 2015, Vol. 9, Iss. 4, pp. 164-171.
2、Jingna Si *, Rui Zhao and Rongling Wu, An Overview of the Prediction of Protein DNA-Binding Sites, International Journal of Molecular Sciences. 2015, 16, 5194-5215.
3、Jingna Si, Jin Chen, Rongling Wu, PFGD: A systematic functional genomics resource for Poplar. 2014 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, p18-22.
4、JingNa Si, Tao Zhou, Wenhao Bo, Fang Xu and Rongling Wu, Genome-wide analysis of salt-responsive and novel microRNAs in Populus euphratica by deep sequencing, BMC Genetics. 2014, 15(Suppl 1): S6.
5、 JingNa Si, Zengming Zhang, Biaoyang Lin, Michael Schroeder and Bingding Huang, MetaDBSite: a meta approach to improve protein DNA-binding site prediction, BMC Systems Biology. 2010, 5(Suppl 1):S7.
6、 Jing-Na Si, Ren-Xiang Yan, Chuan Wang, Ziding Zhang and Xiao-Dong Su, TIM-Finder: A novel method to recognize TIM-barrel proteins. BMC Structural Biology. 2009, 9:73.
7、Ren-Xiang Yan, Jing-Na Si, Chuan Wang and Ziding Zhang, DescFold: A web server for protein fold recognition. BMC Bioinformatics. 2009, 10:416.
8、Chunfa Tong, Bo Zhang, Zhong Wang, Meng Xu, Xiaoming Pang, Jing-Na Si, MinRen Huang, Rongling Wu, Multiallelic epistatic model for an out-bred cross and mapping algorithm of interactive quantitative trait loci. BMC Plant Biology. 2011, 11:148.
9、Chuan Wang, Ren-Xiang Yan, Xiao-Feng Wang, Jing-Na Si, Ziding Zhang, Comparison of linear gap penalties and profile-based variable gap penalties in profile-profile alignments. Comput Biol Chem. 2011, 35(5):308-18.